Patofisiologi iritis belum diketahui secara pasti. Peradangan intraokular timbul karena respon imun bawaan (innate) dan respon imun adaptif. Imunitas bawaan mengenali antigen mikroba (virus, bakteri) dan antigen asing lainnya, kemudian menghancurkannya menggunakan makrofag, sel mast, dan neutrofil. Imunitas adaptif meningkatkan respon imun setelah paparan berulang terhadap satu jenis antigen. Sel yang berperan dalam respon imun adaptif adalah antigen presenting cells, limfosit B, limfosit T, dan makrofag. Kedua respon imun tersebut berguna untuk melindungi tubuh terhadap antigen asing. Namun, disregulasi respon imun bawaan dan adaptif dapat menimbulkan kerusakan pada jaringan, termasuk pada kasus iritis. [2]

Pada kasus iritis traumatik, trauma pada mata menyebabkan kerusakan dan kematian sel. Debris sel-sel mati tersebut merangsang reaksi inflamasi lokal. Reaksi inflamasi ditandai dengan peningkatan permeabilitas pembuluh darah yang mengakibatkan mediator inflamasi dan sel darah putih keluar ke kamera okuli anterior (KOA). [4]

Pada iritis nontraumatik akibat infeksi, timbul reaksi imunitas terhadap antigen mikroba yang kemudian menimbulkan kerusakan pada sel-sel dan pembuluh darah traktus uvea (iris termasuk di dalamnya). Di kasus penyakit autoimun, reaksi hipersensitivitas berperan dalam kerusakan pada traktus uvea. [3]