Pengawasan klinis penggunaan minoxidil meliputi pengawasan terhadap munculnya efek samping maupun interaksi dengan obat lain.[3]

Pasien yang menggunakan minoxidil topikal memerlukan pengawasan berkala apakah terjadi perubahan pada kulit kepala, hipertrikosis lokal/ generalisata, atau hirsutism pada wanita.[8]

Jarang dilaporkan terjadi hipotensi pada pasien yang menggunakan minoxidil topikal namun beberapa dokter merekomendasikan pengukuran tekanan darah, denyut jantung, dan perubahan pada elektrokardiografi secara teratur pada penggunaan terapi minoxidil.[19]