Epidemiologi micropenis terjadi pada anak dengan jenis kelamin laki-laki, dan angka kejadiannya bervariasi antarnegara. Micropenis sudah dapat dikenali sejak lahir, meskipun terkadang dapat terjadi keterlambatan diagnosis.[8]

Global

Prevalensi micropenis secara global tidak diketahui secara pasti. Beberapa data mendapatkan bahwa prevalensi micropenis di Amerika Serikat adalah 1,5 per 10.000 anak laki-laki, sedangkan studi di Brazil mendapatkan prevalensi micropenis sebesar 0,66%. Studi lain yang dilakukan terhadap 227 anak yang datang ke poli urologi mendapatkan bahwa terdapat sebanyak 2,6% anak prapubertas yang mengalami micropenis.[1,6,9]