Komplikasi prostatitis sebagian besar terkait dengan infeksi. Komplikasi dari infeksi prostat bisa bersifat sistemik seperti sepsis atau terlokalisir ke kelenjar prostat seperti abses. Abses prostat terutama terjadi pada pasien immunocompromised, pasien diabetes, dan pasien yang menggunakan kateter jangka panjang atau dialisis).

Komplikasi lain seperti sistitis rekuren, epididimitis, retensi urin, obstruksi saluran kemih, masalah ginjal seperti pielonefritis atau cedera ginjal akut, serta disfungsi ereksi dan infertilitas juga dapat terjadi.[10]