Komplikasi ventilation-perfusion lung scan (V/Q scan) atau lung scintigraphy umumnya tidak ada. Namun, beberapa kasus dapat menimbulkan reaksi alergi terhadap radiotracer atau reaksi lokal pada area injeksi. Pasien mungkin mengalami bengkak atau kemerahan pada lokasi injeksi.

Untuk menghindari komplikasi pada ibu hamil/menyusui akibat paparan radiasi, pengurangan eksposur radiasi dilakukan dengan hanya menjalankan skintigrafi perfusi paru saja, tanpa melakukan skintigrafi ventilasi paru. Manfaat V/Q scan pada kehamilan atau ibu menyusui adalah skrining tromboemboli paru akut maupun kronik.[1,3]