Kontraindikasi otoscopy adalah rasa nyeri pada telinga yang diakibatkan oleh laserasi atau cedera lainnya, yang akan mengganggu pemeriksaan dan dapat melukai pasien. Pada kondisi tersebut, sebaiknya otoscopy tidak dilakukan.[6]

Kontraindikasi relatif otoscopy adalah pasien berusia anak-anak yang tidak kooperatif dan tidak bisa tenang, bahkan setelah anak tersebut telah dibantu dipegang oleh orang tua atau wali. Pasien seperti ini berisiko tinggi mengalami trauma.[5]

Riwayat operasi telinga bukan merupakan kontraindikasi otoscopy. Namun, otoscopy pada pasien seperti ini harus dilakukan dengan lebih hati-hati dan lembut. Pasien pascaoperasi telinga biasanya mengalami kecemasan tentang prosedur serta lebih mungkin untuk bergerak-gerak selama prosedur.[6]