Patofisiologi penyakit Hashimoto berhubungan dengan autoimunitas yang disertai dengan infiltrat limfositik, termasuk sel T dan B pada jaringan tiroid. Proses yang mencetuskan autoimunitas pada penyakit Hashimoto belum diketahui pasti. Tetapi, pada penyakit Hashimoto ditemukan sel T bermigrasi dari perifer ke kelenjar tiroid dan diduga berperan dalam proses autoimun.

Penyakit Hashimoto juga dapat berkembang akibat penyakit Graves dan sebaliknya. Kedua kelainan ini berkaitan secara patofisiologis. Sekitar 15-20% pasien dengan penyakit Graves telah dilaporkan mengalami penyakit Hashimoto akibat tiroiditis kronis.

Autoimunitas pada Penyakit Hashimoto