Hingga saat ini, etiologi pasti migraine belum diketahui. Namun, migraine dilaporkan memiliki hubungan kuat dengan faktor genetik. Sebanyak 70–80% penderita migraine memiliki riwayat keluarga penderita migraine juga. Risiko terkena migraine meningkat hingga 4 kali lipat pada orang dengan keluarga yang menderita migraine dengan aura.

Faktor Genetik

Migraine diketahui memiliki hubungan yang kuat dengan faktor genetik. Salah satu contohnya adalah familial hemiplegic migraine (FHM). FHM adalah subtipe migraine yang langka dan yang berhubungan dengan defek genetik pada kromosom 1, 2, dan 19. FHM merupakan migraine dengan aura yang diawali atau diikuti dengan gejala hemiplegia yang sembuh dengan sendirinya.