Kontraindikasi pemeriksaan coronary computed tomography angiography (CCTA) terutama pada kehamilan dan jika terdapat riwayat reaksi anafilaksis terhadap kontras. Kontraindikasi lainnya adalah sebagai berikut:

• Pasien yang tidak dapat kooperatif terhadap protokol pemeriksaan dan instruksi menahan nafas

• Pasien yang terlalu besar untuk muat pada scanner CT

• Gangguan ginjal, baik gagal ginjal akut maupun penyakit ginjal kronis

• Hemodinamik tidak stabil dan riwayat hipotensi
• Riwayat paru reversibel, misalnya asthma (kontraindikasi relatif)
• Penggunaan rutin inhibitor fosfodiesterase, misalnya sildenafil
• Penyakit kardiovaskular: stenosis aorta berat, hipertropik kardiomiopati, gagal jantung dekompensata, Blok Atrioventricular (AV) signifikan. [11,12]