Etiologi narkolepsi adalah akibat interaksi faktor genetik dan lingkungan yang menyebabkan hilangnya atau disfungsi neuron orexin di hipotalamus lateral secara selektif. Proses ini diperkirakan dimediasi oleh sistem imun.[1]

Genetik

Penelitian pada anak kembar monozigot menunjukkan konkordansi narkolepsi sebesar 25-32%. Angka narkolepsi familial juga hanya 1-2%. Kurang dari 2% pasien dengan narkolepsi mempunyai anggota keluarga dengan gangguan yang sama.[1,6] Hal ini menunjukkan kemungkinan kecil bahwa gangguan ini diwariskan.