Kontraindikasi electroencephalography atau EEG tidak ada bila prosedur dilakukan secara tepat. Pemeriksaan ini bersifat noninvasif, sehingga tidak memiliki risiko membahayakan pasien.[1,13]

Namun, sebaiknya EEG tidak dilakukan kepada pasien yang membutuhkan terapi oksigen konsentrasi tinggi. Hal ini karena arus listrik pada mesin EEG dapat menyalakan api saat bersinggungan dengan oksigen, sehingga dapat terjadi kebakaran.[1,13]